Richard Yoel Flores Iuit | Bioinformático e Ingeniero en Biotecnología

Sobre mí

Ingeniero en biotecnología enfocado en bioinformática computacional, automatización de pipelines y análisis de datos biológicos. Trabajo con Python, R y herramientas especializadas para construir flujos reproducibles, analizar secuencias y extraer hallazgos accionables desde datos complejos a gran escala.

Áreas: NGS, Genómica, Machine Learning, Pipelines, Visualización, Automatización.

Habilidades

Lenguajes & Datos

Python
R
Bash / Shell
SQL
JavaScript
JSON

Bioinformática

BLAST
MEME
Clustal
CD-Hit
HMMER
trimAl

Herramientas & Plataformas

AlphaFold2
Nextflow
Excel
Git / GitHub
NCBI / UniProt / Ensembl
ClickUp
Postman
Apps Script
Linux
Strapi

Librerías Python/R

BioPython
Pandas / NumPy
Matplotlib / Seaborn
Selenium
ggplot2
Requests / HTTPX
Rich
pytest

Visualización & Modelado

PyMOL
UCSF Chimera
Jupyter Notebooks
Data Studio

IA & Automatización

Claude Code
Codex
AI Skills
Zapier
Make
APIs & Integrations
Apache Airflow
Google Sheets Automation

Proyectos

Regulación del operón SpoIIIA

Mapeé motivos conservados, regulación transcripcional y ortólogos KEGG en más de 10k especies de Bacillota, destacando cómo SigE promueve spoIIIA/spoIIID y SpoIIID reprime el operón.

Análisis bioinformático en servidor Bash con bases de datos biológicas para estudiar conservación y regulación transcripcional en Bacillota.

Tecnologías: Python, MEME, BLAST, Clustal, CD-Hit, HMMER, KEGG, Bash.

Bio Toolkit CLI

CLI Linux-first para buscar, descargar, cachear, analizar y exportar secuencias biológicas desde NCBI, UniProt, KEGG, AlphaFold y archivos locales.

Herramienta modular por capas con flujos guiados, cache, análisis FASTA/GenBank, BLAST remoto, exportaciones estructuradas y pruebas automatizadas.

Tecnologías: Python, Typer, Rich, Pydantic, APIs & Integrations, Biopython, NCBI, UniProt, KEGG, BLAST.

GitHub

Automatización OCR y seguimiento

Conecté ClickUp, SMS por API, Strapi/PostgreSQL, Dropbox y OCR con IA para automatizar seguimiento, documentos y registros operativos.

Flujo multisistema con webhooks, validación continua, extracción documental por coordenadas, CSV validados y creación automática de registros en base de datos.

Tecnologías: Python, ClickUp, Zapier, APIs & Integrations, PostgreSQL, Strapi, Dropbox, OCR, Claude Code.

Reconocimientos

Premios y congresos

Primer lugar en Ciencias Biológicas y Química — Consejo Quintanarroense de Humanidades, Ciencias y Tecnologías (2024). Primer lugar por investigación en ciencias biológicas y química.
Presentación de cartel en Congreso Internacional de Biotecnología — Sociedad Científica Internacional de Biotecnólogos A.C. (2022). Cartel científico presentado en biotecnología aplicada.
Participación destacada en carteles científicos — Sociedad Científica Juvenil, sede Mérida (2024). Reconocimiento por comunicación científica en cartel.

Certificaciones y cursos

Curve Fitting Onramp — MathWorks (2024). Ajuste de curvas, comparación de modelos y análisis de resultados.
Optimization Onramp — MathWorks (2024). Optimización numérica y resolución de problemas en MATLAB.
Claude Code in Action — Anthropic (2026). Flujos de desarrollo con Claude Code y agentes de IA.
Programación Estadística con R — UNAM · Coursera (2024). Data Science con R aplicado a programación estadística.

Richard Yoel Flores Iuit — Bioinformático e Ingeniero en Biotecnología